第一、安装的时候数据库的表前缀，最好改一下，不用dedecms默认的前缀dede_,可以改成ljs_,随便一个名称即可。
第二、后台登录开启验证码功能，将默认管理员admin删除，改成一个自己专用的，复杂点的账号，管理员密码一定要长，至少8位，而且字母与数字混合。
第三、装好程序后务必删除install目录
第四、将dedecms后台管理默认目录名dede改掉。
第五、用不到的功能一概关闭，比如会员、评论等，如果没有必要通通在后台关闭。
第六、以下一些是可以删除的目录：
member会员功能
special专题功能
company企业模块
plus\guestbook留言板

以下是可以删除的文件：
管理目录下的这些文件是后台文件管理器，属于多余功能，而且最影响安全,许多HACK都是通过它来挂马的
file_manage_control.php file_manage_main.php file_manage_view.php media_add.php media_edit.php media_main.php

再有：
不需要SQL命令运行器的将dede/sys_sql_query.php 文件删除。
不需要tag功能请将根目录下的tag.php删除。不需要顶客请将根目录下的digg.php与diggindex.php删除。

第七、多关注dedecms官方发布的安全补丁，及时打上补丁。
第八、下载发布功能（管理目录下soft__xxx_xxx.php），不用的话可以删掉，这个也比较容易上传小马的.
第九、DedeCms官网出的万能安全防护代码,登录dedecms官网论坛查看.
第十、最安全的方式：本地发布html，然后上传到空间。不包含任何动态内容，理论上最安全，不过维护相对来说比较麻烦。
十一，还是得经常检查自己的网站，被挂黑链是小事，被挂木马或删程序就很惨了，运气不好的话，排名也会跟着掉。所以还得记得时常备份数据.